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Cuando los ríos discurren por el valle, la pendiente se reduce, y lo mismo hace la velocidad del agua y su turbulencia. Al disminuir la fuerza del arrastre, se produce la sedimentación de los materiales orgánicos y minerales. La composición de las gravas del fondo depende de la constitución geológica de la cuenca vertiente por la que discurre el río, en la que pueden predominar las rocas calizas o silíceas.

En las zonas más remansadas de las riberas del río, algunas plantas encuentran su primera oportunidad para enraizar, entre las gravas y guijarros sedimentados. En este tramo de río hay gran número de especies de algas microscópicas de los grupos Chlorophiceas, Cyanophyceas y Diatomeas que juegan un papel importante como indicadores de calidad y a su vez sirven de alimento a muchos organismos ramoneadores que proliferan en este tramo, sobre todo moluscos. Otro grupo importante de organismos macroscópicos asociados a tramos medios son los filtradores y los recolectores que se encuentran en gran proporción mientras que los trituradores disminuyen por las propias características del tramo.

En este tramo de río se pueden encontrar moluscos: ejemplares adultos de mejillón de agua dulce o madreperla del río (Margaritifera margaritifera). La distribución de esta especie en el Cantábrico abarca desde el río Narcea en Asturias hasta el río Tea en Pontevedra localizándose en numerosos ríos de Galicia Costa. No hay constancia en ríos más orientales.

Entre la fauna vertebrada se incluye también la trucha (Salmo trutta), así como su pariente y emblema de los ríos cantábricos, el salmón atlántico (Salmo salar). Después de permanecer de uno a tres inviernos en aguas de Groenlandia, de las islas Feroes o costas de Noruega, un fuerte instinto hace que el salmón vuelva al río que le vio nacer, pese a estar a miles de kilómetros. Gracias a su olfato, el pez reconoce las aguas donde nació y penetra río arriba. La crecida del río y el aumento del caudal suponen una gran resistencia a vencer, pero también le permite remontar rápidos que con menos caudal le dejarían varado.

Otra especie piscícola que puede encontrarse en el tramo medio de la cuenca del Cantábrico es la alosa o sábalo (Alosa alosa) perteneciente a la familia de los cupleidos, por su carácter anádromo remonta los cursos medios y bajos hasta límites generalmente coincidentes con presas o escalas salmoneras no superables debido a su menor capacidad natatoria. Su presencia en nuestras latitudes es menor que la de los salmónidos, siendo mucho más abundante en los ríos franceses de fachada Atlántica. Otra especie del mismo genero es la saboga (Alosa falax) muy parecida a la anterior aunque algo más pequeña, ambas especies se ven afectadas (además de por los obstáculos) por la degradación de los tramos bajos de los ríos que impide el retorno de sus poblaciones.

Entre marzo y agosto podemos ver al avión zapador (Riparia riparia), así llamado por su costumbre de excavar largos túneles en taludes terrosos, en cuyo extremo nidifica. Es una especie muy gregaria, que constituye bandos numerosos y agrupa sus nidos en colonias. Su presencia está amenazada por obras que eliminan los taludes verticales de alguna ribera erosionada por el río, en los que anidan.

A continuación se citan las especies animales y vegetales más comunes en la parte media de los cauces:

  • Algas microscópicas de los grupos Chlorophiceas, Cyanophyceas y Diatomeas líquenes que soportan la inmersión casi permanente, musgos y hepáticas
  • Plantas superiores del género Potamogeton, Ranunculaceas
  • Especies vegetales como las salgueras y sauces arbustivos, colonizando los islotes fluviales y riberas o playas fluviales
  • Sauce o sarga de hoja estrecha (Salix eleagnos)
  • Salguera negra (Salix atrocinerea)
  • Sauce blanco (Salix alba)
  • Mimbrera (Salix fragilis)
  • Chopos
  • Álamos negros (Populus nigra)
  • Álamo temblón (Populus tremula)
  • Álamo blanco (Populus alba)
  • Aliso o “humero” (Alnus glutinosa)
  • Mejillón de agua dulce o madreperla del río (Margaritifera margaritifera)
  • Peces: trucha (Salmo trutta), el salmón atlántico (Salmo salar), alosa o sábalo (Alosa alosa), saboga (Alosa falax).
  • Fauna herpetológica: salamandra rabilarga (Chioglossa lusitanica)
  • Martín pescador (Alcedo atis)
  • Lavandera de cascada (Motacilla cinerea)
  • Avión zapador (Riparia riparia)
  • Garza real (Ardea cinerea)
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